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L'action de Lain se déroule dans un Japon à
peu près contemporain, mais où
les technologies informatiques sont plus évoluées qu'en
réalité. Le point de départ de l'histoire est
le suicide d'une jeune fille, Chisa Yomoda. Dans les jours
qui suivent sa mort, certaines de ses camarades de classe reçoivent
pourtant des e-mails semblant avoir été envoyés
par la défunte.
L'héroïne de la série, Lain Iwakura, une collégienne
de 14 ans, tout d'abord assez ignorante en informatique, est interrogée
par ses amies pour savoir si elle aussi a reçu un mail.
Elle se connecte donc ce soir-là pour s'apercevoir qu'elle
aussi a reçu un message de Chisa. A partir de ce moment, Lain
va progressivement entrer dans ce monde parallèle qu'est le
Réseau ("The Wired"), mais de nombreux mystères
surgissent. Nous apprenons bientôt qu'une autre fille, ressemblant
très fortement à Lain, mais avec une personnalité
opposée, existe à la fois sur le Wired et dans le
monde réel...

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